Règlement (CE) N° 2073/2005 denrées alimentaires.
Microbiologie alimentaire
Microbiologie alimentaire :
quels risques et quelles analyses ?
Les micro-organismes pathogènes (bactéries, levures, moisissures) et les virus peuvent contaminer les aliments à différentes étapes de la chaîne de production, entraînant des risques pour la santé des consommateurs, des non-conformités réglementaires et des rappels de produits. La mise en œuvre d’un plan de surveillance microbiologique permet de prévenir ces risques, de maîtriser la qualité des productions et de garantir la conformité des produits.
Grâce à ses laboratoires spécialisés en microbiologie alimentaire, Phytocontrol accompagne les professionnels de l’agroalimentaire dans la recherche, l’identification et le dénombrement des principaux micro-organismes d’intérêt. Nos équipes s’appuient sur les technologies les plus performantes, combinant méthodes de culture conventionnelles, méthodes rapides et techniques de biologie moléculaire, afin de fournir des résultats fiables, sensibles et dans des délais optimisés.
Les analyses microbiologiques sont essentielles pour garantir la sécurité sanitaire des denrées alimentaires.


PLAN DE CONTRÔLE
Une expertise analytique au service
de la microbiologie alimentaire
Plus de 20 ans d’expertise dans les analyses microbiologiques dans les aliments.
Un laboratoire central et deux laboratoires de proximité assurent une couverture géographique optimale, une logistique sécurisée et des délais d’acheminement maîtrisés, tout en garantissant un haut niveau de qualité analytique.
Un parc technologique de dernière génération de plus de 500m² dédié aux analyses en microbiologie alimentaire, reflet de notre capacité à traiter des volumes importants avec un haut niveau de maîtrise.
Plus de 40 000 échantillons contrôlés en microbiologie alimentaire en 2025, illustrant la robustesse de nos processus et l’ampleur de notre activité.
Phytocontrol accompagne les professionnels de l’agroalimentaire dans la maîtrise des risques microbiologiques grâce à une expertise analytique reconnue et un accompagnement personnalisé pour la mise en place, la réalisation et le suivi de leurs plans de contrôle.
- Analyses PCR en temps réel (ou qPCR) : détection ultra-rapide, hautement sensible, spécifique et quantifiable des pathogènes.
- Identification des bactéries et des levures : Phytocontrol s’appuie sur la spectrométrie de masse MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization – Time of Flight), une technologie de référence permettant d’identifier les micro-organismes en quelques minutes à partir de colonies issues de milieux de culture. Cette approche innovante renforce la rapidité et la fiabilité des résultats.
- Réseau de laboratoires accrédités : Phytocontrol assure le prélèvement, l’acheminement et le traitement rapide des échantillons sur l’ensemble du territoire. Les laboratoires de Nîmes et de Rennes sont accrédités COFRAC, tandis que le laboratoire de Barcelone est accrédité ENAC, garantissant un haut niveau de qualité et de conformité aux référentiels internationaux.
Au-delà de la réactivité et la qualité analytique, Phytocontrol saura vous accompagner à l’égard des nombreux arrêtés, règlements et guides de bonnes pratiques d’hygiène des filières et des interprofessions :
Saisine AFSSA n° 2007-SA-0174 Hygiène des procédés.
Guide de la Fédération du Commerce et de la Distribution
Guide de bonnes pratiques d’hygiène et d’application des principes HACCP pour les fruits et légumes frais non transformés.
Guide de bonnes pratiques d’hygiène et d’application des principes HACCP pour la collecte du lait cru et les fabrications de produits laitiers
Guide de bonnes pratiques d’hygiène et d’application des principes HACCP dans l’industrie de la semoulerie de blé dur.
Pharmacopée Européenne Chapitre 5.1.8 Qualité microbiologique des médicaments à base de plantes pour usage oral et des extraits utilisés dans leur préparation.
EXPERTISE
Quels micro-organismes pathogènes analysons-nous ?
Phytocontrol recherche, identifie et dénombre les principaux micro-organismes d’intérêt dans les aliments :
- ASR
- Listeria spp & monocytogenes
- Salmonella
- E coli O157 :H7
- Pseudomonas spp à 25°C et 30°C
- Clostridium perfringens
- Bacillus cereus
- Flore aérobie thermophile
- Flore totale
- Micro-organismes à 30°C
- Levures et moisissures
- Enterobactéries
- Escherichia coli
- Staphylocoques
- Bactéries anaérobies sulfito réductrices
- Bactéries lactiques mésophiles
- Bactéries Gram négatives
- Candida albicans
- Coliformes
QUALITÉ
Nos accréditations
L’ensemble des laboratoires du Groupe Phytocontrol est accrédité dans le domaine de la microbiologie alimentaire, respectivement par le COFRAC pour les sites de Nîmes et de Rennes, et par l’ENAC pour le site de Barcelone.
Témoignage
Comment accompagnons-nous Julie, Responsable Qualité d’un fabricant de produits traiteurs,
dans la maîtrise du risque microbiologique ?

En microbiologie, la réactivité est essentielle. Nous avons besoin de résultats fiables et rapides pour libérer nos lots en toute confiance. Avec Phytocontrol, nous bénéficions d’un véritable partenariat : les équipes sont disponibles, les délais sont respectés et les échanges techniques sont toujours très constructifs. C’est un laboratoire sur lequel nous pouvons compter pour garantir la sécurité de nos produits et répondre aux exigences de nos clients.
Au dela de l’analyse
Nos formations
Formations recommandées
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Microbiologie
Comprenez les principaux dangers microbiologiques et leur maîtrise en industrie alimentaire.
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Bonnes Pratiques d’Hygiène
Renforcez vos pratiques d’hygiène pour limiter les risques de contamination.
7hInscription
Des questions sur nos analyses ou votre projet ?
Nos conseillers vous répondent sous 24h. Décrivez-nous votre besoin.
FILIÈRES
Les produits concernés par les résidus de pesticides
Phytocontrol accompagne et conseille l’ensemble des acteurs des filières Alimentation conventionnelle, Agriculture Biologique, Babyfood, Cosmétiques et Pharmaceutique.